Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CDCA4Q9BXL8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDCA4Q9BXL8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms