Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LIMD2Q9BT23 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LIMD2Q9BT23 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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