Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UTP23Q9BRU9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UTP23Q9BRU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UTP23Q9BRU9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP23Q9BRU9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP23Q9BRU9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP23Q9BRU9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP23Q9BRU9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UTP23Q9BRU9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms