Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM47Q9BQJ4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMEM47Q9BQJ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMEM47Q9BQJ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms