Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPF18Q99633 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPF18Q99633 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms