Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMD1Q99460 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMD1Q99460 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMD1Q99460 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms