Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSF3RQ99062 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSF3RQ99062 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms