Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRBNQ96SW2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRBNQ96SW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CRBNQ96SW2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CRBNQ96SW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms