Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCCC1Q96RQ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MCCC1Q96RQ3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCCC1Q96RQ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms