Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSPG4P5Q96PW8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSPG4P5Q96PW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSPG4P5Q96PW8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms