Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CFAP57Q96MR6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CFAP57Q96MR6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CFAP57Q96MR6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms