Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKNOX2Q96KN3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKNOX2Q96KN3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PKNOX2Q96KN3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms