Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC35E1Q96K37 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC35E1Q96K37 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms