Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EAF1Q96JC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
EAF1Q96JC9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms