Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MRPL48Q96GC5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MRPL48Q96GC5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms