Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00526Q96FQ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00526Q96FQ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms