Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC10A4Q96EP9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC10A4Q96EP9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC10A4Q96EP9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms