Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
RAB3CQ96E17 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms