Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SDCCAG3Q96C92 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SDCCAG3Q96C92 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms