Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCAF4Q8WV16 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCAF4Q8WV16 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCAF4Q8WV16 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms