Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUY9

DEPDC1B, DEP domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1BQ8WUY9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DEPDC1BQ8WUY9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC1BQ8WUY9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC1BQ8WUY9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms