Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF3IP1Q8TDR0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms