Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MDM1Q8TC05 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MDM1Q8TC05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MDM1Q8TC05 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms