Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FBXO27Q8NI29 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO27Q8NI29 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO27Q8NI29 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms