Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCPH1Q8NEM0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MCPH1Q8NEM0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MCPH1Q8NEM0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.4 ms