Protein–RNA interactions for Protein: Q8N357

SLC35F6, Solute carrier family 35 member F6, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F6Q8N357 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC35F6Q8N357 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC35F6Q8N357 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC35F6Q8N357 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms