Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D3Q8IZS8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D3Q8IZS8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms