Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
APLFQ8IW19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APLFQ8IW19 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APLFQ8IW19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms