Protein–RNA interactions for Protein: Q86U17

SERPINA11, Serpin A11, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA11Q86U17 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SERPINA11Q86U17 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SERPINA11Q86U17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms