Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMC1Q7Z7K0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CMC1Q7Z7K0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMC1Q7Z7K0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms