Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX9Q7RTT3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX9Q7RTT3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms