Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDHR3Q6ZTQ4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDHR3Q6ZTQ4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms