Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT07

TBC1D9, TBC1 domain family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D9Q6ZT07 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TBC1D9Q6ZT07 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TBC1D9Q6ZT07 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TBC1D9Q6ZT07 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TBC1D9Q6ZT07 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms