Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM44Q6ZP01 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM44Q6ZP01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM44Q6ZP01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms