Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AAGABQ6PD74 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AAGABQ6PD74 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms