Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1L6

ZNF343, Zinc finger protein 343, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF343Q6P1L6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ZNF343Q6P1L6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF343Q6P1L6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms