Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGB2Q6NT52 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGB2Q6NT52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms