Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ55

TTBK2, Tau-tubulin kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK2Q6IQ55 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TTBK2Q6IQ55 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TTBK2Q6IQ55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms