Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ATG9BQ674R7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG9BQ674R7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATG9BQ674R7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms