Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LARP1BQ659C4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1BQ659C4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LARP1BQ659C4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms