Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TAF3Q5VWG9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TAF3Q5VWG9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms