Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SOGA3Q5TF21 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SOGA3Q5TF21 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOGA3Q5TF21 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms