Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPANXN4Q5MJ08 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPANXN4Q5MJ08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms