Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ODF2Q5BJF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ODF2Q5BJF6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ODF2Q5BJF6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms