Protein–RNA interactions for Protein: Q53T94

TAF1B, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1BQ53T94 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TAF1BQ53T94 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TAF1BQ53T94 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms