Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL38Q2WGJ6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL38Q2WGJ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL38Q2WGJ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms