Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC6LQ2NKX8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC6LQ2NKX8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC6LQ2NKX8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms