Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SWI5Q1ZZU3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SWI5Q1ZZU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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