Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKIDA1Q1XH10 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKIDA1Q1XH10 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms