Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNXAQ16473 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNXAQ16473 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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